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Use este identificador para citar ou linkar para este item: https://bdtd.inpa.gov.br/handle/tede/1781
Tipo do documento: Tese
Título: Distribuição e diversidade filogenética de lagartos da Amazônia brasileira
Autor: Oliveira, Deyla Paula de 
Primeiro orientador: Hrbek, Tomas
Resumo: Métodos para quantificar o esforço amostral, estimar as relações filogenéticas e as divergências genéticas das espécies têm permitindo entender os processos evolutivos e históricos envolvidos na estruturação das comunidades e na diferenciação entre as espécies. Focando em lagartos, esta tese teve como objetivo investigar os seguintes temas: (1) a quantificação do esforço amostral das coletas realizadas em seis localidades da Amazônia brasileira; (2) inferir a estrutura filogenética dessas seis comunidades de lagartos usando dados gerados a partir do DNA barcode (gene mitocondrial COI); (3) gerar dados de distâncias genéticas dentro e entre as espécies de lagartos de 22 localidades da Amazônia brasileira por meio de DNA barcode e (4) avaliar a divergência genética para taxa chaves (Plica plica e P. umbra) a partir do DNA barcode, 16S rRNA, e do marcador nuclear PRLR. A tese está organizada em cinco capítulos experimentais, bem como uma introdução geral. Capítulos 1 a 5 são organizadas sob a forma de artigos científicos. No capítulo I foi quantificado o esforço de amostragem de lagartos inventariados em um único local e posteriormente no capítulo II em seis locais na Amazônia brasileira. No Capítulo III foram utilizadas amostras de DNA de espécies de lagartos nas seis áreas inventariadas na Amazônia brasileira para avaliar a estrutura filogenética das comunidades com base numa árvore gerada com o marcador mitocondrial CO1. No Capítulo IV, um banco de dados CO1 para 54 espécies de lagartos de 22 locais na Amazônia brasileira foi estabelecida. No Capítulo V, inferiu-se a diversidade intra e interespecífica de duas espécies de lagartos Plica (Plica plica e Plica umbra) com o uso dos marcadores mitocondriais CO1, 16S rRNA e um gene nuclear (receptor de prolactina - PRLR). A riqueza das espécies inventariadas nas seis localidades foi similar ao encontrado em outros inventários realizados em áreas da bacia Amazônica. A amostragem foi representativa da riqueza de espécies esperada para cada área inventariada, com o encontro de espécies comuns, com ampla distribuição pela bacia Amazônica e espécies com distribuição mais restrita a certas áreas e ambientes. O DNA barcode permitiu conhecer a distribuição da diversidade genética de 54 espécies de lagartos amazônicos. Encontrada alta divergência intraespecífica e delimitação em mais do que uma entidade evolutiva em 34 espécies. Sendo assim, pressume-se que a diversidade das espécies de lagartos encontra-se subestimada. Plica plica e Plica umbra compreendem mais do que uma entidade evolutiva distinta estruturada através da paisagem amazônica e as linhagens encontradas para ambas as espécies são em grande parte concordantes com a formação hipotética das áreas de endemismo propostas para a Amazônia brasileira.
Abstract: divergences of species have allowed a better understanding of the evolutionary and historical processes involved in community structuring and differentiation between species. Focussing on lizards, this thesis aims to investigate these themes by: (1) quantifying sampling effort of collections made across six locations in the Brazilian Amazon; (2) inferring the phylogenetic structure these six communities of lizards using data generated from the DNA barcodes (mitochondrial gene COI); (3) generating genetic distances within and between lizard species at 22 locations in the Brazilian Amazon through DNA barcoding; and (4) assessing genetic divergences for key taxa (Plica plica and P. umbra) from DNA barcodes, 16S rRNA, and the nuclear PRLR marker. The thesis is organized into five experimental chapters, as well as a general introduction. Chapters one to five are organized in the form of scientific articles. In Chapter I, we quantified the sampling efforts of inventoried lizards in one location , and subsequently in II, at six locations in the Brazilian Amazon. In Chapter III, we used DNA samples of species of lizards in the six scheduled areas of the Brazilian Amazon to assess the phylogenetic structure of the communities with based on a tree generated with the mitochondrial marker CO1. In Chapter IV an CO1 database for 54 species of lizards of 22 locations in the Brazilian Amazon has been established. In Chapter V, it was inferred intra- and interspecific diversity of two species of Plica lizards (Plica plica and Plica umbra) with the use of mitochondrial markers CO1, 16S rRNA and a nuclear gene (prolactin receptor - PRLR). Our results offer an overview of the lizards of the Brazilian Amazon and contributes to an increased knowledge of the group in terms of their genetic and spatial diversity. The richness of species inventoried in the six locations was similar to that found in other inventoried conducted in areas of the Amazon basin. The sample was representative of the richness of expected species inventoried for each area, with the encounter of common species, widely distributed by the Amazon basin and species with more restricted distribution to certain areas and environments. The DNA barcode allowed to know the distribution of the genetic diversity of 54 species of Amazonian lizards. Found intraspecific divergence and high definition of more than one entity 34 evolutionary species. Thus, it assumes that the diversity of lizards is underestimated. Plica plica and Plica umbra comprise more than a distinct evolutionary entity structured through the Amazonian landscape and the lineages found for both species are largely consistent with the hypothetical formation of areas of endemism proposals for the Brazilian Amazon.
Palavras-chave: Lagartos
Filogenética
Marcador molecular
Área(s) do CNPq: CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
Idioma: por
País: Brasil
Instituição: Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia
Sigla da instituição: INPA
Departamento: Coordenação de Pós Graduação (COPG)
Programa: Genética, Conservação e Biologia Evolutiva (GCBEv)
Citação: OLIVEIRA, Deyla Paula de. Distribuição e diversidade filogenética de lagartos da Amazônia brasileira. Manaus: [s.n.], 2015. xvi, 230f. Tese (Genética, Conservação e Biologia Evolutiva (GCBEv)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.
Tipo de acesso: Acesso Aberto
Endereço da licença: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
URI: http://localhost:8080/tede/handle/tede/1781
Data de defesa: 28-Mai-2015
Aparece nas coleções:Doutorado - (GCBEv)

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