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dc.creatorCasanova , Frida Mesel-
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/4130819423472695por
dc.contributor.advisor1Nozawa , Sérgio Ricardo-
dc.date.accessioned2015-08-20T15:04:09Z-
dc.date.issued2008-10-16-
dc.identifier.citationCASANOVA , Frida Mesel. Caracterização in Silico de biossensores em Colossoma Macropomum: diagnóstico molecular e monitoramento de ambientes impactados. 2008. 84f. Dissertação( Genética, Conservação e Biologia Evolutiva (GCBEv)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus, 2008 .por
dc.identifier.urihttp://localhost:8080/tede/handle/tede/1917-
dc.description.resumoUma grande diversidade de peixes é encontrada na Bacia Amazônica, e estes representam mais que metade das espécies de vertebrados aquáticos totais conhecidos no mundo. O Colossoma macropomum (tambaqui) tem sido adotado freqüentemente como espécie-modelo para o entendimento de processos fisiológicos modulados por variáveis ambientais na Amazônia. Metais como o cobre e cádmio, em ambientes aquáticos, podem interferir severamente nos processos biológicos dos peixes em função da grande área branquial exposta ao meio. Juvenis de tambaqui foram expostos a três diferentes tratamentos: (1) exposição de 1 e 3 horas a concentrações subletais de cobre [CuSO4. 5H2O (20 μg/L)]; (2) exposição de 1 e 3 horas a concentrações subletais de cádmio [Cd(NO3).4H2O (10μg/L); (3) estresse mecânico por 5 minutos diários durante 3 dias consecutivos. Foram extraídos fígado (tratamentos 1 e 2) e músculo (tratamento 3) dos peixes expostos. No presente estudo foram categorizados, através do BLAST2GO, os bancos de dados de Danio rerio (zebrafish) e Ictalurus punctatus (bagre de canal), disponíveis no NCBI (National Center for Biotechnology Information, USA, www.ncbi.nlm.nih.gov), e usados para comparação das bibliotecas de cDNA de tambaqui expostos aos referidos tratamentos. Paralelamente, foi verificada, por meio do RT-PCR, expressão gênica em tambaqui das enzimas catalase, heat shock protein, glutamina sintase e citocromo p450 obtidas do banco de dados do I. punctatus e D. rerio. Os genes rag 2 e trop foram selecionados da biblioteca de tambaqui e submetidos à análise de qPCR. As atividades enzimáticas da GST e catalase foram dosadas em peixes tratados com metais pesados. O banco de dados de Ictalurus punctatus mostrou uma maior quantidade de genes (37%) agrupados em processos biológicos, da mesma forma, apresentou-se o banco de Danio rerio (40%). As análises das bibliotecas de tambaqui mostraram expressão de aproximadamente 900 gene, dentre eles, o GST, catalase, CYP450 e HIF 2. Na reação de qPCR, o número de transcritos dos dois genes, rag 2 e trop, destaca-se o aumento nos níveis de mRNA ao ser exposto ao íon cádmio por 3 horas, enquanto que em músculo de peixes submetidos a estresse mecânico, não houve alteração na expressão de transcritos em relação ao controle. As atividades enzimáticas não mostraram diferenças, para ambas enzimas, nos diferentes tratamentos.por
dc.description.abstractThe large diversity of fish found in the Amazon Basin represents over half the total aquatic vertebrate species known in the world. Colossoma macropomum (tambaqui) is frequently used as a model species in the study of physiological processes modulated by environmental variables in the Amazon. Metals in aquatic environments, such as copper and cadmium, may interfere with the biological processes of fish severely due to their large branchial area exposed to the environment. Juvenile tambaquis were exposed to three different treatments: (1) 1- and 3-h exposure to subletal concentrations of copper [CuSO4.5H2O (20 μg/L)], (2) 1- and 3-h exposure to subletal concentrations of cadmium [Cd(NO3).4H2O (10 μg/L), (3) mechanical stress for 5 min daily during 3 consecutive days. The liver (treatments 1 and 2) and muscle (treatment 2) of treated fish were removed for cDNA library construction and sequencing analysis. The data obtained were categorized through BLAST2GO, the Danio rerio (zebrafish) and Ictalurus punctatus (bagre de canal) databases available from NCBI (National Center for Biotechnology Information, USA, www.ncbi.nlm.nih.gov) and compared to the cDNA library of tambaqui exposed to the same treatments. Simultaneously, gene expression of enzyme catalase, heat shock protein, glutamine synthase, and cytochrome p450 obtained from the I. punctatus and D. rerio, from ESTs. Databases were analyzed by RT-PCR. Genes rag 2 and trop were selected from the tambaqui library and submitted to qPCR. The enzymatic activities of GST and catalase in fish treated with heavy metals were determined. No significant difference was found, possibly due to the short exposure time and the expression of their respective mRNAs. The Ictalurus punctatus database provided a larger amount of grouped genes (37%) in biological processes, similarly to the Danio rerio (40%) database. The analysis of the libraries of tambaqui revealed the expression of approximately 900 genes, including GST, catalase, CYP450, and HIF-2. The number of transcripts of genes rag 2 and tropomyosin in the qPCR reaction stood out for the increased levels of mRNA after the exposure of fish to cadmium ion for 3 h, while the muscle of fish submitted to mechanical stress did not present changes in the expression of transcripts in relation to the control.por
dc.description.provenanceSubmitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2015-08-20T15:04:09Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Frida.pdf: 1668025 bytes, checksum: 92a37d6393e5436258d2771be253c2b1 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)eng
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2015-08-20T15:04:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Frida.pdf: 1668025 bytes, checksum: 92a37d6393e5436258d2771be253c2b1 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2008-10-16eng
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAMpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.languageporpor
dc.publisherInstituto Nacional de Pesquisas da Amazôniapor
dc.publisher.departmentCoordenação de Pós Graduação (COPG)por
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.initialsINPApor
dc.publisher.programGenética, Conservação e Biologia Evolutiva (GCBEv)por
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/-
dc.subjectColossoma macropomumpor
dc.subjectPeixespor
dc.subjectExpressão gênicapor
dc.subjectMetais pesadospor
dc.subjectBiblioteca de cDNApor
dc.subject.cnpqGENETICA::GENETICA ANIMALpor
dc.titleCaracterização in Silico de biossensores em Colossoma Macropomum: diagnóstico molecular e monitoramento de ambientes impactadospor
dc.typeDissertaçãopor
Aparece nas coleções:Mestrado - (GCBEv)

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